The ABINIT Users Mailing List ( CLOSED )

[matthieu verstraete <Matthieu.Verstraete@ulg.ac.be>]

This one worked, but the last time I used it was a year ago.
Normally the HPC people at cines should give you example files.

Matthieu


>>>>>>>>>>>>>>>>
#!/bin/bash -xv
#PBS -N x_234b3

## pour recevoir les fichiers d’erreurs (.err) et de sorties (.log) par 
e-mail.
#PBS -m ae -M YOUREMAIL

## nom des fichiers d’erreurs (.err) et de sorties (.log).
#PBS -e x230.err
#PBS -o x230.log

## ressources allouées :
#PBS -l select=8:ncpus=8:mpiprocs=8

## temps d’exécution prévu :
#PBS -l walltime=24:00:00

############################################################################
df
## récupération de la liste de noms des nœuds alloués pour le calcul
cat $PBS_NODEFILE

## aller dans le directory ou la soumission a été exécutée (où se
trouve l’exécutable)
cd $PBS_O_WORKDIR

export MPI_GROUP_MAX=4096
export MPI_COMM_MAX=4096

echo $MPI_GROUP_MAX
echo $MPI_COMM_MAX

ABINIP=YOURPATH/abinit

## lancement de l’exécutable
/usr/pbs/bin/mpiexec  ${ABINIP} < t.files > log.$PBS_JOBID
<<<<<<<<<<<<




On Fri, Feb 12, 2010 at 4:15 PM, jacky even <jacky.even@insa-rennes.fr> wrote:
> Has anyone a simple example of pbs script for calculation at cines ?
> best regards
> jeven
>



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Prof. Matthieu Verstraete

Universite de Liège
Institut de Physique, Bat. B5, 3/7
Allée du 6 aout, 17
B- 4000 Sart Tilman, Liège
Belgium

Associate member European Theoretical Spectroscopy Facility (ETSF
http://www.etsf.eu)

Phone : +32 4 366 90 17
Fax   : +32 4 366 36 29

Mail : matthieu.verstraete@ulg.ac.be
          matthieu.jean.verstraete@gmail.com