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forum - Re: [abinit-forum] pbs script example for abinit at cines

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Subject: The ABINIT Users Mailing List ( CLOSED )

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Re: [abinit-forum] pbs script example for abinit at cines


Chronological Thread 
  • From: jacky even <jacky.even@insa-rennes.fr>
  • To: forum@abinit.org
  • Subject: Re: [abinit-forum] pbs script example for abinit at cines
  • Date: Fri, 12 Feb 2010 18:21:01 +0100

matthieu verstraete a écrit :
This one worked, but the last time I used it was a year ago.
Normally the HPC people at cines should give you example files.

Matthieu


#!/bin/bash -xv
#PBS -N x_234b3

## pour recevoir les fichiers d’erreurs (.err) et de sorties (.log) par
e-mail.
#PBS -m ae -M YOUREMAIL

## nom des fichiers d’erreurs (.err) et de sorties (.log).
#PBS -e x230.err
#PBS -o x230.log

## ressources allouées :
#PBS -l select=8:ncpus=8:mpiprocs=8

## temps d’exécution prévu :
#PBS -l walltime=24:00:00

############################################################################
df
## récupération de la liste de noms des nœuds alloués pour le calcul
cat $PBS_NODEFILE

## aller dans le directory ou la soumission a été exécutée (où se
trouve l’exécutable)
cd $PBS_O_WORKDIR

export MPI_GROUP_MAX=4096
export MPI_COMM_MAX=4096

echo $MPI_GROUP_MAX
echo $MPI_COMM_MAX

ABINIP=YOURPATH/abinit

## lancement de l’exécutable
/usr/pbs/bin/mpiexec ${ABINIP} < t.files > log.$PBS_JOBID
<<<<<<<<<<<<




On Fri, Feb 12, 2010 at 4:15 PM, jacky even <jacky.even@insa-rennes.fr> wrote:
Has anyone a simple example of pbs script for calculation at cines ?
best regards
jeven




Ok!
Thanks a lot Mathieu and Philippe ...
Jacky



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